報告が遅れましたが、先日Movable Typeをver3.35にアップしました。
　作業工程は既に他の皆さんが解説されているので、詳しく書きませんが、今回は通常のバージョンアップとは違って、いくつか注意点があります。

１）手動でＤＢをバージョンアップする必要がある。
　表示されるガイダンスどおり進めていけばＯＫです。ただし、万一…ということがあるので作業前にＤＢのバックアップを取っておくことをお勧めします。（私は一応、取ってから作業しました。）

２）テンプレートの書き換えが必要。
　これは今までのバージョンアップでは無かったことなんですが、今回は手動でコメントテンプレートの一部を書き換える必要があります。
　忘備録として書いておきますと、コメント・プレビューテンプレートにあるコメント投稿フォーム部分の下記の部分、MTCommentPreviewに
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
input id="comment-author" name="author" size="30" value="<$MTCommentPreviewAuthor$>"
input id="comment-email" name="email" size="30" value="<$MTCommentPreviewEmail$>"
input id="comment-url" name="url" size="30" value="<$MTCommentPreviewURL$>"
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

encode_html="1"をそれぞれ書き加えます。
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
input id="comment-author" name="author" size="30" value="<$MTCommentPreviewAuthor encode_html="1"$>"
input id="comment-email" name="email" size="30" value="<$MTCommentPreviewEmail encode_html="1"$>"
input id="comment-url" name="url" size="30" value="<$MTCommentPreviewURL encode_html="1"$>"
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

　あとは通常のバージョンアップと同じですね。私の場合は小粋空間さんの記事を参考にして差分アップをしたので、作業自体は十数分で終了しました

　で、ここまでは順調だったんですが、問題がこのあと発生しまして…。